275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2044 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  100 
 
 
369 aa  740    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  75.07 
 
 
360 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  60.23 
 
 
355 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  60.23 
 
 
355 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  60.23 
 
 
355 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  57.14 
 
 
360 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  56.13 
 
 
353 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  55.93 
 
 
376 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  48.37 
 
 
344 aa  348  9e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  48.27 
 
 
365 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  49.32 
 
 
380 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  48.28 
 
 
360 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  48.7 
 
 
365 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  46.24 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  46.24 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  49.28 
 
 
356 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  47.9 
 
 
363 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  45.8 
 
 
363 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  47.69 
 
 
360 aa  282  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  44.41 
 
 
367 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  34.48 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  34.57 
 
 
357 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  36.29 
 
 
357 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  38.36 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.24 
 
 
351 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 
353 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  32.77 
 
 
351 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  32.49 
 
 
351 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  35.9 
 
 
359 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  31.91 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
353 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.14 
 
 
349 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  31.12 
 
 
360 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  35.63 
 
 
357 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  32.93 
 
 
343 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
348 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  29.1 
 
 
351 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  31.2 
 
 
350 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  32.63 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  32.44 
 
 
348 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  33.72 
 
 
348 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  30.91 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  31.49 
 
 
348 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  31.04 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  32.44 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.5 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.9 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  32.4 
 
 
348 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  31.42 
 
 
357 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
363 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
285 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
208 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
265 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  35.92 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
276 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.35 
 
 
213 aa  53.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
204 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.52 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.44 
 
 
269 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.56 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  34.91 
 
 
212 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.19 
 
 
266 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.13 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 
202 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.52 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  33.87 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.91 
 
 
205 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.16 
 
 
269 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.52 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.52 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.52 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.52 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
275 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.52 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.43 
 
 
352 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  30.51 
 
 
371 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.62 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>