More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2033 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  779    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  69.71 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  69.71 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  69.71 
 
 
386 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  65.5 
 
 
373 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  68.68 
 
 
380 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  62.94 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  63.81 
 
 
374 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  64.96 
 
 
385 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  66.76 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  61.84 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  62.1 
 
 
366 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  61.29 
 
 
368 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  60.38 
 
 
373 aa  421  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  60.92 
 
 
369 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  60.27 
 
 
386 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  61.6 
 
 
385 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  61.46 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  60.26 
 
 
389 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  56.72 
 
 
372 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  51.96 
 
 
372 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  50.12 
 
 
425 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  52.63 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  51.27 
 
 
357 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  43.84 
 
 
367 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  48.57 
 
 
370 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  49.49 
 
 
385 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  54.41 
 
 
266 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  40.65 
 
 
356 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  42.11 
 
 
421 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  40.16 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  42.32 
 
 
433 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  49.63 
 
 
483 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  42.21 
 
 
375 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  40.12 
 
 
323 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  41.13 
 
 
369 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  40.53 
 
 
360 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  38.92 
 
 
376 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  39.71 
 
 
323 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.98 
 
 
329 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  36.36 
 
 
340 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  39.2 
 
 
316 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  37.43 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  36.54 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  36.96 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  37.78 
 
 
306 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.79 
 
 
340 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  38.07 
 
 
306 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  39 
 
 
318 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.68 
 
 
340 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  37.13 
 
 
338 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  34.47 
 
 
372 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  37.71 
 
 
453 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.68 
 
 
341 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.76 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  36.65 
 
 
342 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  37.39 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.39 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.39 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.39 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  37.11 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.66 
 
 
248 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.18 
 
 
244 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  36.84 
 
 
315 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  36.99 
 
 
341 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  36.99 
 
 
341 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  36.99 
 
 
341 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  31.66 
 
 
385 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  36.71 
 
 
341 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  35.24 
 
 
356 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  36.71 
 
 
341 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  36.71 
 
 
341 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.42 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  34.94 
 
 
343 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  34.94 
 
 
343 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  31.12 
 
 
372 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  34.52 
 
 
327 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  32.56 
 
 
319 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.52 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.37 
 
 
379 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  35.62 
 
 
329 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.18 
 
 
240 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  32.85 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  35.69 
 
 
312 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  33.73 
 
 
334 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.96 
 
 
331 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  45.2 
 
 
225 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  31.59 
 
 
398 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  33.15 
 
 
325 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  35.86 
 
 
334 aa  142  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.5 
 
 
365 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  33.91 
 
 
333 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  34.31 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  33.52 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.61 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.64 
 
 
250 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  34.01 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  26.92 
 
 
400 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  33.77 
 
 
370 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>