More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2028 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  51.85 
 
 		 770 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  60.67 
 
 		 710 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  53.95 
 
 		 729 aa  700    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  71.09 
 
 		 722 aa  999    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  57.83 
 
 		 741 aa  817    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  58.35 
 
 		 713 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  62.61 
 
 		 719 aa  861    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  52.85 
 
 		 722 aa  698    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  59.68 
 
 		 729 aa  800    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  61.15 
 
 		 718 aa  890    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  65.03 
 
 		 717 aa  890    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  58.35 
 
 		 713 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  65.03 
 
 		 717 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  57.76 
 
 		 674 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  58.87 
 
 		 714 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  100 
 
 		 726 aa  1448    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  63.49 
 
 		 719 aa  901    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  57.74 
 
 		 696 aa  712    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  56.21 
 
 		 701 aa  760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  61.03 
 
 		 708 aa  851    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  58.35 
 
 		 713 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.97 
 
 		 695 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.93 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.68 
 
 		 695 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  38.59 
 
 		 680 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  36.48 
 
 		 679 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.78 
 
 		 682 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  39.36 
 
 		 677 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.61 
 
 		 673 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.75 
 
 		 691 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  34.39 
 
 		 694 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  38.52 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  34.74 
 
 		 696 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.45 
 
 		 670 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.14 
 
 		 696 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  34.63 
 
 		 697 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  36.78 
 
 		 693 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.74 
 
 		 682 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  34.49 
 
 		 694 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  34.86 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  34.21 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.96 
 
 		 683 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  34.05 
 
 		 673 aa  422  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  33.77 
 
 		 696 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  34.73 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  34.58 
 
 		 697 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  34.53 
 
 		 697 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  33.63 
 
 		 696 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  34.2 
 
 		 694 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.82 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.19 
 
 		 692 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.89 
 
 		 683 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  34.68 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  35.73 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  37.05 
 
 		 686 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  41.8 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  39.46 
 
 		 687 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  36.07 
 
 		 687 aa  409  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.67 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  35.97 
 
 		 697 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  33.48 
 
 		 682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  35.57 
 
 		 691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  36.78 
 
 		 656 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  36.39 
 
 		 685 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  35.55 
 
 		 701 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  36.79 
 
 		 699 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  32.71 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  34.21 
 
 		 688 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  36.86 
 
 		 681 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.9 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.15 
 
 		 683 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.77 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  35.55 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  34.05 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.92 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  35.44 
 
 		 707 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  37.23 
 
 		 688 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  32.52 
 
 		 693 aa  395  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.01 
 
 		 683 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  31.86 
 
 		 693 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  36.47 
 
 		 687 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  35.9 
 
 		 707 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  32.52 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.49 
 
 		 697 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  33.19 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.25 
 
 		 701 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  34.43 
 
 		 692 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  33.19 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  35.15 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.67 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  34.48 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  34.29 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  34.06 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  34.88 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  35.19 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  34.14 
 
 		 703 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.95 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  35.26 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  32.71 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  32.62 
 
 		 691 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>