More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1918 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  100 
 
 
368 aa  745    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 
333 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  46.73 
 
 
339 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  45.12 
 
 
335 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 
339 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  43.44 
 
 
348 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  43.73 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  44.55 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  42.07 
 
 
351 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  43.33 
 
 
336 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 
340 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  42.18 
 
 
342 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  43.11 
 
 
338 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  45.03 
 
 
346 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 
372 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  43.24 
 
 
340 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 
348 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  40.17 
 
 
359 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  40.24 
 
 
362 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 
346 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  38.55 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  40 
 
 
359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  41.48 
 
 
346 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  37.01 
 
 
360 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  37.01 
 
 
360 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  39.47 
 
 
340 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  37.01 
 
 
360 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 
363 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  37.01 
 
 
360 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  39.09 
 
 
355 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  37.01 
 
 
363 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  37.01 
 
 
360 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  36.72 
 
 
363 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  37.01 
 
 
363 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  37.17 
 
 
358 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  39.48 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  36.97 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 
359 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  34.76 
 
 
358 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  34.76 
 
 
358 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  36.92 
 
 
357 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 
348 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  33.43 
 
 
357 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  33.43 
 
 
357 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  33.43 
 
 
357 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 
352 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
342 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  33.43 
 
 
357 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.33 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.26 
 
 
333 aa  172  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.31 
 
 
342 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 
332 aa  166  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  32.94 
 
 
340 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 
339 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
345 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 
330 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.53 
 
 
333 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  31.91 
 
 
357 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  34.23 
 
 
371 aa  160  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.62 
 
 
347 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 
335 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.54 
 
 
334 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.23 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
339 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 
333 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 
333 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  31.05 
 
 
345 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  34.59 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.76 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.53 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.53 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  33.53 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 
341 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 
333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 
348 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 
341 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.75 
 
 
337 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
368 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.23 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 
342 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 
336 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.03 
 
 
334 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.42 
 
 
333 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 
334 aa  149  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.95 
 
 
330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.55 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  30.75 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  34.64 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 
344 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 
361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  33.68 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  31.09 
 
 
332 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 
343 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>