More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1791 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  40.68 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  38.11 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  38.26 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  35.28 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  36.18 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  37.73 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.96 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  35.91 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  37.69 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  38.2 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  36.23 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  35.66 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  35.45 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  35.51 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  36.03 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  35.51 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  35.51 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  33.57 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  33.79 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  28.28 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  28.77 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  32.21 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  32.21 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  32.21 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  33.1 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  27.95 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.43 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.85 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.08 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.39 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  27.91 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  34.46 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.08 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  28.38 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  31.2 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  27.61 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  30.71 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  31.46 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  30.71 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.11 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 322 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  34.91 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  28.46 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  31.43 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  29.59 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  29.89 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  28.35 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  26.01 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.65 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  30.71 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  27.65 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  33.56 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.58 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  28.97 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  29.35 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  31.72 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  31.73 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  30.57 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.47 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29.15 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.21 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>