More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1752 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  58.77 
 
 		 222 aa  237  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  50.94 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  51.15 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  45.75 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 242 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 242 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  31.88 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  35.76 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  38.16 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  33.95 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 262 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 267 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 254 aa  85.5  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  34.62 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 256 aa  85.1  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 257 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>