More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1714 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  613  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  57.63 
 
 
319 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  57.19 
 
 
308 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  54.21 
 
 
312 aa  305  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  57.45 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  57.55 
 
 
303 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  55.24 
 
 
319 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  57.99 
 
 
259 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.9 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  44.69 
 
 
358 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  44.87 
 
 
351 aa  241  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  45.42 
 
 
301 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  43.83 
 
 
307 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  44.71 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  44.81 
 
 
341 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 
367 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  42.9 
 
 
334 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  46.9 
 
 
337 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  43.55 
 
 
338 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  41.37 
 
 
384 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  43.29 
 
 
330 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  43.97 
 
 
304 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  43.65 
 
 
324 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  45.77 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  41.58 
 
 
325 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  41.8 
 
 
327 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  44.62 
 
 
306 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  39.74 
 
 
319 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  46.69 
 
 
330 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  43.37 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  41.99 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  43.38 
 
 
325 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  39.81 
 
 
390 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  39.87 
 
 
409 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  42.71 
 
 
299 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  38.85 
 
 
384 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  41.53 
 
 
337 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  42.86 
 
 
300 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  41.46 
 
 
317 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  41.12 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  40.89 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  40.89 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  40.89 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  38.29 
 
 
408 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  40.06 
 
 
421 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  40.06 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  42 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  40.19 
 
 
308 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  43.14 
 
 
291 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  40.26 
 
 
375 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  40.59 
 
 
324 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  40.61 
 
 
336 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  41.28 
 
 
299 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  39.6 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  41.34 
 
 
361 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  37.83 
 
 
332 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  39.86 
 
 
349 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  39.7 
 
 
329 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.21 
 
 
349 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  40.41 
 
 
294 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  40.54 
 
 
311 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.51 
 
 
347 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  38.93 
 
 
341 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.86 
 
 
349 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  39.86 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  39.51 
 
 
349 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  40.97 
 
 
290 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  41.97 
 
 
295 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  43.14 
 
 
291 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  43.14 
 
 
291 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  38.33 
 
 
318 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  39.57 
 
 
352 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  39.73 
 
 
306 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  37.62 
 
 
325 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  36.84 
 
 
826 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  35.25 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  33.22 
 
 
510 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  37.88 
 
 
433 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  34.2 
 
 
829 aa  148  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  36.21 
 
 
586 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.81 
 
 
751 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.27 
 
 
742 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  35.52 
 
 
517 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  44.2 
 
 
398 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  35.35 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.14 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 
517 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.52 
 
 
348 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 
259 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.99 
 
 
348 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31.77 
 
 
614 aa  119  7e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.67 
 
 
338 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  40.88 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.89 
 
 
668 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.96 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.3 
 
 
554 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  32 
 
 
288 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  32.78 
 
 
314 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>