More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1615 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  82.58 
 
 
448 aa  690  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.29465e-11 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  853  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  48.41 
 
 
418 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  49.64 
 
 
437 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  51.29 
 
 
446 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  49.88 
 
 
442 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  47.37 
 
 
423 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  49.39 
 
 
426 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  49.39 
 
 
426 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 
443 aa  357  2e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  48.28 
 
 
398 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  47.58 
 
 
447 aa  343  3e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  51.83 
 
 
441 aa  339  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 
447 aa  332  8e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 
423 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
438 aa  321  1e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  48.09 
 
 
428 aa  320  2e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  46.2 
 
 
460 aa  290  5e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  41.77 
 
 
446 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
430 aa  263  7e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
439 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 
486 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  36.51 
 
 
430 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
411 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
421 aa  129  1e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
421 aa  116  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
425 aa  112  2e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26.92 
 
 
418 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  25.68 
 
 
430 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.41 
 
 
430 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
439 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
437 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
415 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  24.29 
 
 
417 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.22 
 
 
434 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.67 
 
 
417 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.84 
 
 
432 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.63 
 
 
428 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.27 
 
 
430 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
441 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.7 
 
 
430 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.13 
 
 
445 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.93 
 
 
432 aa  98.2  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  25.81 
 
 
452 aa  94.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.17 
 
 
432 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  25.81 
 
 
452 aa  93.2  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  22.92 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.63 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  28.12 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.31 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.2 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  27.83 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  25.2 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.46 
 
 
428 aa  85.9  1e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
395 aa  86.3  1e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.65 
 
 
443 aa  85.9  1e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.46 
 
 
428 aa  85.5  2e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  21.96 
 
 
434 aa  84.7  3e-15  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  25.77 
 
 
443 aa  84.3  4e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  26.45 
 
 
437 aa  84  5e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.65 
 
 
443 aa  83.2  8e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  26.81 
 
 
432 aa  83.2  9e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  21.93 
 
 
434 aa  82.4  1e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  27.66 
 
 
428 aa  82  2e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  26.17 
 
 
437 aa  82  2e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  24.17 
 
 
431 aa  81.6  2e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
431 aa  81.6  2e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  27.66 
 
 
428 aa  81.6  3e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.73012e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
411 aa  80.9  4e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  22.67 
 
 
423 aa  80.1  6e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  22.67 
 
 
423 aa  80.5  6e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 
446 aa  80.1  8e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  24.44 
 
 
451 aa  79  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
413 aa  77.4  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  24.61 
 
 
418 aa  77.4  5e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
414 aa  77.4  5e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.3 
 
 
425 aa  74.7  3e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.3 
 
 
425 aa  74.7  3e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  28.57 
 
 
427 aa  73.6  6e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28.57 
 
 
422 aa  73.6  6e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
392 aa  73.2  9e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.35 
 
 
418 aa  70.5  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  22.03 
 
 
446 aa  70.9  5e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  22.03 
 
 
446 aa  70.9  5e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.94 
 
 
420 aa  70.1  7e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
437 aa  70.1  7e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.98759e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.57 
 
 
437 aa  70.1  7e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.3 
 
 
420 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  26.32 
 
 
413 aa  68.6  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  27.75 
 
 
407 aa  67.4  5e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
411 aa  67  6e-10  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  21.52 
 
 
410 aa  66.2  1e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  28.57 
 
 
427 aa  66.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  22.56 
 
 
439 aa  66.2  1e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
413 aa  66.2  1e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  25.35 
 
 
412 aa  65.9  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  22.31 
 
 
384 aa  65.5  2e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  27.73 
 
 
412 aa  65.5  2e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.36 
 
 
410 aa  65.5  2e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  21.65 
 
 
426 aa  65.1  2e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>