More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1521 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 
346 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  86.54 
 
 
362 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  69.31 
 
 
321 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  63.61 
 
 
310 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  64.31 
 
 
318 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  62.03 
 
 
331 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  61.78 
 
 
324 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  61.98 
 
 
317 aa  358  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.5 
 
 
318 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.19 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.19 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  61.95 
 
 
315 aa  355  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  62.21 
 
 
311 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.58 
 
 
314 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  60 
 
 
317 aa  351  8.999999999999999e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  61.61 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.71 
 
 
311 aa  342  5e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  62.13 
 
 
311 aa  340  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  64.82 
 
 
311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  61.24 
 
 
313 aa  332  8e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  58.48 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.88 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  55.77 
 
 
306 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  55.41 
 
 
301 aa  318  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  59.41 
 
 
308 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  60.7 
 
 
313 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  57.19 
 
 
328 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  59.02 
 
 
299 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  57.7 
 
 
310 aa  309  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.63 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  58.26 
 
 
344 aa  298  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  55.13 
 
 
314 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  49.84 
 
 
308 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  52.99 
 
 
332 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.13 
 
 
299 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  50.98 
 
 
443 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.32 
 
 
296 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.78 
 
 
298 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  47.73 
 
 
295 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  44.88 
 
 
295 aa  261  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  45.31 
 
 
319 aa  259  7e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.89 
 
 
295 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  41.83 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  45.75 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  42.35 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  40.98 
 
 
296 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  50.48 
 
 
316 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  40.72 
 
 
296 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 
295 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 
295 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  42.95 
 
 
295 aa  242  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.97 
 
 
302 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  41.83 
 
 
307 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  43.41 
 
 
302 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  51.41 
 
 
383 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  41.69 
 
 
307 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  39.74 
 
 
296 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 
297 aa  238  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  36.27 
 
 
296 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  44.3 
 
 
292 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  42.62 
 
 
295 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  45.63 
 
 
298 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  44.48 
 
 
314 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.69 
 
 
307 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  42.43 
 
 
302 aa  236  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  41.97 
 
 
295 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  40.46 
 
 
305 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  43 
 
 
292 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 
309 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.31 
 
 
295 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  42.28 
 
 
317 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
304 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 
304 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  39.55 
 
 
306 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  42.05 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  38.59 
 
 
310 aa  225  8e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  39.02 
 
 
304 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.29 
 
 
302 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  40.98 
 
 
295 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  38.64 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  38.96 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  37.13 
 
 
300 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  37.79 
 
 
299 aa  220  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.2 
 
 
298 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  40.72 
 
 
297 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  37.13 
 
 
291 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 
298 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>