More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1518 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  90.48 
 
 		 579 aa  1018    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 579 aa  1119    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  52.81 
 
 		 567 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  53.05 
 
 		 575 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  52.32 
 
 		 611 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  53.36 
 
 		 580 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  51.21 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  50.84 
 
 		 584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  49.21 
 
 		 570 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  49.4 
 
 		 583 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  50.86 
 
 		 574 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  49.58 
 
 		 593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  49.41 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  49.83 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  52.5 
 
 		 578 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  48.9 
 
 		 585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  48.53 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  49.47 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  49.05 
 
 		 583 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  48.22 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  48.79 
 
 		 592 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  46.53 
 
 		 592 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  45.49 
 
 		 590 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  46.53 
 
 		 612 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  44.65 
 
 		 590 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  43.74 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  44.07 
 
 		 587 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  45.38 
 
 		 591 aa  360  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  43.89 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  43.89 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  44.33 
 
 		 587 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  43.67 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  42.61 
 
 		 590 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.78 
 
 		 577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 		 594 aa  325  1e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  37.87 
 
 		 608 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 567 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 573 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.6 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.15 
 
 		 554 aa  293  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.87 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.06 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  38.34 
 
 		 553 aa  286  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  36.24 
 
 		 589 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.52 
 
 		 554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 565 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.23 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 580 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  39.48 
 
 		 556 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 573 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.17 
 
 		 568 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  32.63 
 
 		 562 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.89 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  36.82 
 
 		 568 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.4 
 
 		 553 aa  279  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 549 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14810  DNA repair protein RecN  37 
 
 		 536 aa  279  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0277816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.89 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.69 
 
 		 552 aa  277  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 549 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 		 579 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 549 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.96 
 
 		 553 aa  276  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 		 579 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.55 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.55 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.55 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.55 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  38.14 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  31.01 
 
 		 579 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 553 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.63 
 
 		 552 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  31.67 
 
 		 561 aa  273  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 553 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 553 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.46 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  36 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>