More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1500 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
335 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  94.22 
 
 
333 aa  616  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  71.47 
 
 
319 aa  438  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  64.84 
 
 
308 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  60.65 
 
 
315 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  61.34 
 
 
310 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  60.52 
 
 
311 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 
330 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  59.62 
 
 
338 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  59.94 
 
 
322 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  59.29 
 
 
310 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  58.12 
 
 
321 aa  361  1e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  57.42 
 
 
307 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  57.42 
 
 
307 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 
306 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
307 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
307 aa  354  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  57.28 
 
 
307 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 
307 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
306 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 
310 aa  347  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  61.98 
 
 
314 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  55.34 
 
 
308 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  60.7 
 
 
314 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 
323 aa  341  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  54.84 
 
 
307 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  55.27 
 
 
310 aa  339  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  53.99 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  53.4 
 
 
309 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 
312 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
312 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  51.92 
 
 
340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  53.25 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
321 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  48.3 
 
 
306 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
301 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  48.24 
 
 
309 aa  288  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
302 aa  288  8e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
307 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
298 aa  285  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
303 aa  285  9e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
303 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 
300 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
304 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
304 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 
319 aa  278  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
309 aa  278  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
308 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
323 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
307 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
313 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  44.13 
 
 
311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  46.77 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  45.71 
 
 
309 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 
305 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
304 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
308 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  49.43 
 
 
305 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  45.05 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
309 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 
305 aa  272  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1697  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
306 aa  272  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
309 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
329 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  44.13 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
305 aa  269  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
306 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
305 aa  269  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 
308 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
309 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 
305 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
298 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
317 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 
304 aa  268  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
312 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
309 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
309 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  45.02 
 
 
301 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
326 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 
309 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 
326 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  43.13 
 
 
560 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  42.99 
 
 
305 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
307 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 
300 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
309 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>