254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1248 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  84.62 
 
 		 238 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  61.36 
 
 		 223 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  57.66 
 
 		 223 aa  257  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  58.82 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  58.82 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  64.22 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  56.74 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  58.77 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  59.83 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  54.75 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  57.35 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 		 223 aa  244  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  59.15 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  56.74 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  61.5 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  56.48 
 
 		 220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  59.56 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  56.31 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  52.58 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  53.42 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  55.81 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  56.76 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  56.76 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  55.87 
 
 		 223 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  55.36 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  57.01 
 
 		 409 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  55.36 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  53.88 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  56.81 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  51.72 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  54.25 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  54.46 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  56.7 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  52.61 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  56.67 
 
 		 317 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  51.82 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  53.52 
 
 		 221 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  46.61 
 
 		 222 aa  217  2e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  50 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  54.26 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  50 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  54.93 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  48.62 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  52.34 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  53.7 
 
 		 222 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  47.66 
 
 		 219 aa  205  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  52.34 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  53.3 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  53.24 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  50.24 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  47.87 
 
 		 215 aa  202  6e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  53.67 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  51.87 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  51.66 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  53.21 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  53.77 
 
 		 213 aa  199  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  52.75 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6946  deoxyribose-phosphate aldolase  54.95 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1543  deoxyribose-phosphate aldolase  54.95 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  54.95 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.576612 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  45.58 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  47.73 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  49.52 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  45.25 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  47.89 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  53.02 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  47.91 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  50.66 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  51.58 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  43.81 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  42.33 
 
 		 243 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  40.27 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  49.06 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  44.81 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  49.09 
 
 		 219 aa  178  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  47.56 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  50.49 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  42.33 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  49.53 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  41.98 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  51.38 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  41.2 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  41.07 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  52.78 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  40.19 
 
 		 215 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  49.33 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>