64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1205 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  75.6 
 
 
584 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
567 aa  1126    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  89.93 
 
 
586 aa  1005    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  50.52 
 
 
539 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  47.67 
 
 
541 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  46.88 
 
 
592 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  52.05 
 
 
537 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  47.74 
 
 
538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  44.3 
 
 
585 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  43.01 
 
 
572 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  43.73 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  40.87 
 
 
553 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
534 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  40.95 
 
 
547 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  41.73 
 
 
638 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  40.14 
 
 
573 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  45.57 
 
 
563 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
569 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  44.51 
 
 
544 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  41.19 
 
 
528 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  42.12 
 
 
531 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  40.5 
 
 
520 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  40.59 
 
 
539 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  40.66 
 
 
523 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  41.55 
 
 
508 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
541 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 
579 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 
560 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
493 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
493 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
493 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  38.25 
 
 
511 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 
516 aa  296  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  34.76 
 
 
559 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  37.88 
 
 
522 aa  287  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
525 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  37.99 
 
 
507 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  36.93 
 
 
528 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  35.9 
 
 
534 aa  264  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  25.45 
 
 
441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  23.33 
 
 
658 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  24.95 
 
 
469 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  24.79 
 
 
469 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  24.95 
 
 
493 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.58 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.95 
 
 
447 aa  92  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 
968 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  25.95 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  22.63 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  25.33 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
414 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  21.59 
 
 
745 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
439 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  36.7 
 
 
575 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  23.44 
 
 
767 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
553 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.65 
 
 
549 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90238  predicted protein  27.32 
 
 
821 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
557 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 
372 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
554 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
918 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>