191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1161 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  100 
 
 
401 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  83.42 
 
 
395 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  53.49 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  51.96 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  51.07 
 
 
385 aa  344  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  52.38 
 
 
389 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  50.4 
 
 
403 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  50.53 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  49.73 
 
 
409 aa  297  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  47.36 
 
 
418 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  48.04 
 
 
408 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  48.34 
 
 
407 aa  295  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  47.14 
 
 
399 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  48.2 
 
 
429 aa  293  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  48.34 
 
 
400 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  46.08 
 
 
409 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  47.07 
 
 
420 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  44.78 
 
 
414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  43.95 
 
 
391 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  48.48 
 
 
373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  42.44 
 
 
416 aa  282  7.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  48.41 
 
 
376 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  39.42 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  39.68 
 
 
386 aa  272  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.54 
 
 
398 aa  269  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  39.15 
 
 
387 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  43.54 
 
 
387 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  43.94 
 
 
349 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  37.27 
 
 
404 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  40.92 
 
 
389 aa  263  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  40.21 
 
 
382 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  40.21 
 
 
382 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  39.79 
 
 
382 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  39.95 
 
 
382 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  37.04 
 
 
385 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  39.3 
 
 
382 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  39.42 
 
 
405 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  39.31 
 
 
382 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  41.11 
 
 
383 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  41.11 
 
 
383 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  41.11 
 
 
383 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  42.46 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  40.96 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  38.3 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  39.43 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  41.01 
 
 
392 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  38.4 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  38.52 
 
 
382 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  38.52 
 
 
382 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  38.52 
 
 
382 aa  252  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  38.52 
 
 
382 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  38.52 
 
 
382 aa  252  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  37.6 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  41.21 
 
 
383 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  37.73 
 
 
379 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  38.26 
 
 
382 aa  250  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  40.64 
 
 
383 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  44.88 
 
 
362 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  40.56 
 
 
359 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  38.52 
 
 
388 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  41.13 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  37.87 
 
 
384 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  39.58 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  39.58 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  38.02 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  38.7 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  37.38 
 
 
388 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  35.08 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  38.63 
 
 
405 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  42.23 
 
 
363 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.92 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  35.79 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.91 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  36.69 
 
 
394 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  39.77 
 
 
389 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  35.89 
 
 
387 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  39.64 
 
 
393 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  40.62 
 
 
369 aa  229  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.28 
 
 
395 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  31.67 
 
 
351 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  36.78 
 
 
388 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  38.1 
 
 
358 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  35.88 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  40.11 
 
 
388 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  36.26 
 
 
394 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  35.7 
 
 
409 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  35.96 
 
 
385 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  34.46 
 
 
385 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.86 
 
 
412 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  33.59 
 
 
386 aa  217  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  37.65 
 
 
350 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  37.65 
 
 
350 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  43.87 
 
 
390 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  35.24 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  35.24 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  35.24 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  35.24 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  33.76 
 
 
384 aa  213  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  39.35 
 
 
384 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  35.17 
 
 
396 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>