81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1127 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  90.94 
 
 
256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  67.07 
 
 
259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  65.86 
 
 
250 aa  328  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  65.46 
 
 
250 aa  322  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  46.43 
 
 
408 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  45.6 
 
 
413 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  46.64 
 
 
412 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  48.8 
 
 
405 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  46.8 
 
 
410 aa  224  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  46.43 
 
 
406 aa  218  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  46 
 
 
397 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  43.78 
 
 
402 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  45.6 
 
 
423 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  43.32 
 
 
251 aa  215  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  45.6 
 
 
407 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  46.18 
 
 
409 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  47.26 
 
 
257 aa  211  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  40 
 
 
405 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  47.2 
 
 
406 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  44.4 
 
 
406 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  43.78 
 
 
405 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  43.75 
 
 
409 aa  207  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  46.03 
 
 
257 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  43.03 
 
 
415 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  44.18 
 
 
406 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  46.61 
 
 
407 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  50.4 
 
 
418 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  43.43 
 
 
410 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  42.97 
 
 
255 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  41.83 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  41.83 
 
 
410 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  37.94 
 
 
256 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  46 
 
 
259 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  46.22 
 
 
408 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  45.82 
 
 
408 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  32.81 
 
 
259 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  46.53 
 
 
145 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  34.13 
 
 
411 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.46 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  30.3 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  25.47 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  26.32 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.88 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.81 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.12 
 
 
274 aa  58.9  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.33 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  22.73 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.77 
 
 
313 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
338 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  23.83 
 
 
252 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  30.24 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.07 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
340 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  26.96 
 
 
352 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  27.75 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  27.75 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  24.06 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  26.03 
 
 
354 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  28.17 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.29 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  26.52 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  24 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  25.7 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.63 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.31 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  25.96 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.95 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
461 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
362 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  26.2 
 
 
327 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  28.17 
 
 
362 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  20.88 
 
 
265 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  24.42 
 
 
211 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
362 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>