More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0947 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  851    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  57.51 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  55.53 
 
 
448 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  55.18 
 
 
470 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  55.22 
 
 
434 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  54.69 
 
 
444 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  51.87 
 
 
421 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  51.99 
 
 
460 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  50.59 
 
 
533 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  46.1 
 
 
431 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  45.28 
 
 
447 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  48.44 
 
 
439 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  47.97 
 
 
555 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  46.75 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  45.17 
 
 
440 aa  278  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  41.63 
 
 
425 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  40.56 
 
 
425 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  40.56 
 
 
425 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  40.89 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  41.65 
 
 
430 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  40.33 
 
 
425 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  41.08 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  36.19 
 
 
431 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
441 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  35.6 
 
 
446 aa  247  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  42.14 
 
 
421 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  38.63 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  38.97 
 
 
423 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 
434 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  36.82 
 
 
437 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.36 
 
 
442 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0796  CBS domain-containing protein  47.48 
 
 
340 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  35.29 
 
 
432 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.99 
 
 
465 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.44 
 
 
433 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
439 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  37.75 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.97 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0740  CBS domain-containing protein  50 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0817501  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  33.1 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
432 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  32.62 
 
 
439 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  40.05 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  32.62 
 
 
439 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  33.72 
 
 
446 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  33.33 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 
447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  32.61 
 
 
447 aa  216  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  31.49 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.66 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  34.66 
 
 
479 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.22 
 
 
441 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 
431 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.25 
 
 
446 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.93 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.95 
 
 
432 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.7 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.7 
 
 
442 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.7 
 
 
442 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.16 
 
 
442 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
442 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.7 
 
 
442 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  32.48 
 
 
446 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  31.46 
 
 
443 aa  209  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  32.32 
 
 
431 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.47 
 
 
442 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.29 
 
 
440 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.31 
 
 
437 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  32.03 
 
 
426 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.87 
 
 
440 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
435 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
433 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
439 aa  206  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 
428 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  32.7 
 
 
464 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 
431 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
439 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  31.38 
 
 
431 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  33.96 
 
 
434 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.18 
 
 
440 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  31.5 
 
 
429 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  35.1 
 
 
452 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  34.47 
 
 
436 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.54 
 
 
443 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.54 
 
 
443 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  32.77 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.02 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  28.37 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  34.27 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  30.61 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  30.77 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  32.03 
 
 
436 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.85 
 
 
442 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  30 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.63 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  32.71 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  31.92 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  29.16 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  30.12 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>