More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0896 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
615 aa  1223    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  72.3 
 
 
601 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  56.13 
 
 
594 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  57.49 
 
 
607 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  57.99 
 
 
593 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  53.82 
 
 
600 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  56.74 
 
 
597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  51.16 
 
 
594 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  52.31 
 
 
594 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  50.99 
 
 
593 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  52.78 
 
 
601 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  50.57 
 
 
599 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  53.05 
 
 
592 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  48.23 
 
 
624 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  47.94 
 
 
594 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  48.22 
 
 
609 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  52.03 
 
 
612 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  50.08 
 
 
616 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  46.3 
 
 
613 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 
586 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 
630 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  28.76 
 
 
564 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  27.7 
 
 
642 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  28.93 
 
 
565 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  30.46 
 
 
573 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 
593 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  30.61 
 
 
553 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  30.07 
 
 
590 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.39 
 
 
563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.31 
 
 
533 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  30.49 
 
 
534 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  29.06 
 
 
568 aa  194  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  29.39 
 
 
570 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  29.39 
 
 
570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  29.39 
 
 
570 aa  190  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  29.34 
 
 
545 aa  190  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  30.98 
 
 
562 aa  190  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  29.23 
 
 
570 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  29.23 
 
 
570 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  29.23 
 
 
570 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  29.23 
 
 
570 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  28.95 
 
 
563 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  28.57 
 
 
579 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  29.34 
 
 
570 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  28.91 
 
 
541 aa  187  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  27.26 
 
 
643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  31.25 
 
 
543 aa  183  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.59 
 
 
527 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  26.15 
 
 
575 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  30.91 
 
 
525 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  28.64 
 
 
525 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  29.89 
 
 
539 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  25.98 
 
 
575 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  27.6 
 
 
586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  30.88 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  29.4 
 
 
536 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  26.93 
 
 
576 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  30.14 
 
 
531 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  25.61 
 
 
599 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  26 
 
 
556 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  31.51 
 
 
525 aa  160  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  26.17 
 
 
556 aa  160  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  26.16 
 
 
575 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  27.97 
 
 
525 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  26.01 
 
 
561 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.05 
 
 
512 aa  157  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  29.24 
 
 
529 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  24.08 
 
 
604 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  25.33 
 
 
583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  27.41 
 
 
534 aa  154  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  28.81 
 
 
533 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  29 
 
 
535 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  27.48 
 
 
537 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  23.48 
 
 
588 aa  150  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0300  gamma-glutamyltransferase  28.81 
 
 
596 aa  150  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  26.26 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  25.32 
 
 
599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  24.08 
 
 
581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  24.51 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  26.68 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  29.7 
 
 
568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  30.73 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  27.08 
 
 
534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  27.33 
 
 
533 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  29.26 
 
 
574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  28.45 
 
 
525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  28.48 
 
 
539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  26.12 
 
 
576 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  26.82 
 
 
565 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  26.38 
 
 
530 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  26.48 
 
 
576 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  31.71 
 
 
531 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  25.08 
 
 
581 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  25.04 
 
 
589 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  25.6 
 
 
587 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  25.63 
 
 
587 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  29.91 
 
 
542 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  25.7 
 
 
583 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  24.22 
 
 
579 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>