45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0891 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  67.71 
 
 
192 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  43.33 
 
 
211 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  42.78 
 
 
213 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  40.56 
 
 
189 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  43.62 
 
 
218 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  39.78 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  36.56 
 
 
187 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  37.78 
 
 
211 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  36.31 
 
 
205 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  39.18 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  36.13 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  36.11 
 
 
206 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  36.17 
 
 
214 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  37.82 
 
 
197 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  36.26 
 
 
172 aa  105  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  33.86 
 
 
212 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  33.86 
 
 
212 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  33.86 
 
 
222 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  38.12 
 
 
211 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  31.75 
 
 
204 aa  99  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  37.7 
 
 
196 aa  99  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  39.88 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  39.27 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  40 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  37.22 
 
 
201 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  31.11 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  31.76 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  32.95 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  38.3 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  33.13 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  30.96 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  32.78 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  31.72 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  31.52 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  38.26 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  30.98 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  29.57 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  31.18 
 
 
363 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  38.46 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  28.31 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  27.86 
 
 
412 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3308  hypothetical protein  24.55 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2809  hypothetical protein  24.55 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0123  hypothetical protein  25.75 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.142779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>