151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0890 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  40.6 
 
 		 1270 aa  712    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  46.43 
 
 		 1143 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  100 
 
 		 1215 aa  2469    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  47.93 
 
 		 1228 aa  980    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  46.43 
 
 		 1143 aa  867    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  46 
 
 		 1151 aa  881    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  46.43 
 
 		 1143 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  45.57 
 
 		 1163 aa  879    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  46.01 
 
 		 1139 aa  882    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  47.34 
 
 		 1250 aa  946    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  59.43 
 
 		 1215 aa  1321    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  38.07 
 
 		 1247 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  41.03 
 
 		 1196 aa  724    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  44.23 
 
 		 1324 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  38.3 
 
 		 1153 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  36.92 
 
 		 1198 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1118 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  35.82 
 
 		 1082 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1126 aa  466  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1116 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  46.91 
 
 		 522 aa  456  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1172 aa  433  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1350 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1175 aa  403  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  38.03 
 
 		 1280 aa  317  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1121 aa  201  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.33 
 
 		 1271 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1259 aa  110  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.45 
 
 		 606 aa  111  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.96 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.63 
 
 		 934 aa  108  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.77 
 
 		 902 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.68 
 
 		 902 aa  99.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.63 
 
 		 486 aa  95.9  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  25.69 
 
 		 487 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.67 
 
 		 1255 aa  91.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  23.25 
 
 		 512 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.74 
 
 		 1097 aa  85.5  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  26.3 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  26.3 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.04 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.92 
 
 		 1038 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.04 
 
 		 752 aa  79.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  32.95 
 
 		 659 aa  77.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.13 
 
 		 901 aa  76.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.68 
 
 		 1620 aa  74.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.54 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  25.17 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.4 
 
 		 1585 aa  71.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  27.52 
 
 		 494 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.4 
 
 		 1585 aa  71.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  28.85 
 
 		 486 aa  70.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  26.77 
 
 		 1427 aa  70.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.18 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1275 aa  68.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.62 
 
 		 1077 aa  67.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  23.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.06 
 
 		 609 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.82 
 
 		 650 aa  67  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.37 
 
 		 636 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.2 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.21 
 
 		 1111 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.4 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.78 
 
 		 1048 aa  65.1  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  53.57 
 
 		 193 aa  63.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 1653 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.25 
 
 		 553 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.25 
 
 		 553 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.28 
 
 		 686 aa  63.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  25.58 
 
 		 1090 aa  63.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  24.36 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.69 
 
 		 716 aa  63.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.74 
 
 		 622 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.57 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  24.8 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  31.32 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  25.56 
 
 		 454 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  23.41 
 
 		 643 aa  62  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.88 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.66 
 
 		 635 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.47 
 
 		 1121 aa  60.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.18 
 
 		 633 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  24.53 
 
 		 633 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  22.02 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.19 
 
 		 622 aa  60.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  23.82 
 
 		 1261 aa  59.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2245 aa  58.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.59 
 
 		 914 aa  58.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  25.35 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.12 
 
 		 748 aa  58.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25 
 
 		 754 aa  58.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.22 
 
 		 932 aa  58.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  22.38 
 
 		 916 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.24 
 
 		 797 aa  57.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  21.35 
 
 		 633 aa  57.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  30 
 
 		 237 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  24.41 
 
 		 1099 aa  56.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.16 
 
 		 629 aa  55.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  30.46 
 
 		 1457 aa  55.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 		 1196 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>