More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0784 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  97.46 
 
 		 236 aa  431  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  82.28 
 
 		 236 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  74.15 
 
 		 239 aa  345  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.31 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.42 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.5 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.29 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.86 
 
 		 236 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  69.6 
 
 		 238 aa  308  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.1 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  65.38 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  66.67 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  63.33 
 
 		 246 aa  298  7e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  68.44 
 
 		 234 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  67.39 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.5 
 
 		 244 aa  287  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  65.67 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.16 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  59.57 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  60.54 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 248 aa  266  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.55 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  58.05 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  58.05 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  58.05 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  59.65 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.81 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 239 aa  258  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  55.74 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.28 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  55.46 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.65 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.85 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.89 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.96 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  55.04 
 
 		 406 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  58.48 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  54.08 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  56.7 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.28 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  55.98 
 
 		 231 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.98 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  54.51 
 
 		 286 aa  231  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  51.95 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.71 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  55.79 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.74 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  53.65 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.05 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 225 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.67 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.72 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.72 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  47.14 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  46.72 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>