42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0771 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  100 
 
 
377 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  60 
 
 
357 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  33.04 
 
 
363 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  30.16 
 
 
366 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  27.72 
 
 
370 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  29.77 
 
 
366 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  28.86 
 
 
360 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  27.95 
 
 
354 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  28.2 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.63 
 
 
354 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  27.38 
 
 
347 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  27.52 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  27.86 
 
 
373 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.87 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  27.53 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.67 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  24.93 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.93 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  25.47 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  26.39 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  27.03 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  24.63 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  21.92 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  26.15 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.38 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23.53 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  23.06 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.23 
 
 
421 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.23 
 
 
421 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  21.78 
 
 
364 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  24.63 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  28.48 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  22.17 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  27.33 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  31.52 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.64 
 
 
394 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  25.44 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.34 
 
 
753 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  29.7 
 
 
445 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  29.7 
 
 
445 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  20.89 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>