More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0595 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  75.58 
 
 		 224 aa  338  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  55.87 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  28.93 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  42.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  38.98 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.13 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.13 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  47.17 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  40 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>