More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0555 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.91 
 
 
1202 aa  1048    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
1078 aa  2122    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  74.8 
 
 
841 aa  609  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  75.97 
 
 
872 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  74.67 
 
 
878 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  74.42 
 
 
926 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.83 
 
 
872 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.05 
 
 
863 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.55 
 
 
743 aa  559  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  69.51 
 
 
1122 aa  549  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.13 
 
 
678 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  69.35 
 
 
712 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.16 
 
 
715 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  65.8 
 
 
727 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.27 
 
 
729 aa  526  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.32 
 
 
808 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.08 
 
 
732 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.59 
 
 
774 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  61.77 
 
 
637 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.58 
 
 
692 aa  513  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.14 
 
 
737 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.05 
 
 
690 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.41 
 
 
652 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.13 
 
 
765 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.34 
 
 
855 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.2 
 
 
578 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.66 
 
 
713 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.04 
 
 
643 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  60.1 
 
 
690 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  58.9 
 
 
801 aa  483  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.78 
 
 
812 aa  479  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.92 
 
 
616 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.92 
 
 
616 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.66 
 
 
618 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.58 
 
 
960 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.29 
 
 
582 aa  321  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.12 
 
 
579 aa  319  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.43 
 
 
579 aa  311  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.14 
 
 
582 aa  311  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.81 
 
 
569 aa  297  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.91 
 
 
551 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.96 
 
 
561 aa  293  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.45 
 
 
579 aa  292  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.99 
 
 
735 aa  291  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.16 
 
 
562 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.18 
 
 
582 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.84 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.27 
 
 
570 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.13 
 
 
518 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.84 
 
 
562 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.47 
 
 
562 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.47 
 
 
562 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.45 
 
 
632 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.47 
 
 
562 aa  283  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.39 
 
 
562 aa  283  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.47 
 
 
562 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.16 
 
 
562 aa  281  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.31 
 
 
562 aa  281  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.01 
 
 
562 aa  280  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.82 
 
 
559 aa  278  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.43 
 
 
649 aa  277  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.85 
 
 
589 aa  276  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.5 
 
 
617 aa  275  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.05 
 
 
807 aa  273  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.06 
 
 
606 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34 
 
 
900 aa  270  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.21 
 
 
527 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.49 
 
 
518 aa  270  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.67 
 
 
602 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.6 
 
 
588 aa  267  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  36.73 
 
 
652 aa  267  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.57 
 
 
591 aa  267  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.85 
 
 
601 aa  267  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.37 
 
 
755 aa  266  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.85 
 
 
601 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.64 
 
 
724 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.06 
 
 
567 aa  264  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.23 
 
 
663 aa  263  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 
396 aa  262  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.94 
 
 
644 aa  261  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.85 
 
 
606 aa  260  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.37 
 
 
599 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 
637 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.65 
 
 
565 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.65 
 
 
565 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.94 
 
 
611 aa  259  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.29 
 
 
554 aa  258  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.83 
 
 
610 aa  258  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.73 
 
 
695 aa  258  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41 
 
 
690 aa  257  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.31 
 
 
427 aa  257  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.43 
 
 
948 aa  257  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.29 
 
 
568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.4 
 
 
1113 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.77 
 
 
547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.85 
 
 
1071 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.52 
 
 
613 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  38.62 
 
 
650 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.49 
 
 
614 aa  255  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.85 
 
 
1045 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>