More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0522 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  76.11 
 
 
432 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  71.33 
 
 
429 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  70.02 
 
 
427 aa  634    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  96.5 
 
 
429 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
429 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  70.02 
 
 
427 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  70.56 
 
 
428 aa  644    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  82.05 
 
 
429 aa  720    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  66.04 
 
 
427 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  69.39 
 
 
429 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  69.56 
 
 
428 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 
430 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  68.06 
 
 
432 aa  617  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  66.04 
 
 
427 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  66.28 
 
 
428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  66.28 
 
 
427 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  65.81 
 
 
427 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  64.49 
 
 
428 aa  589  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 
429 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  65.57 
 
 
427 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  65.72 
 
 
428 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  65.42 
 
 
428 aa  585  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  64.87 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  64.17 
 
 
445 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  62.85 
 
 
431 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 
428 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  62.62 
 
 
431 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  62.62 
 
 
431 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  62.12 
 
 
433 aa  566  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  62.62 
 
 
431 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  61.68 
 
 
429 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  61.68 
 
 
807 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  61.63 
 
 
432 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 
429 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  63.02 
 
 
433 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  63.79 
 
 
428 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  54.63 
 
 
426 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  52.19 
 
 
438 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  54.95 
 
 
434 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  51.05 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.55 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 
430 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
429 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
427 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
428 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  52.84 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 
428 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  52.66 
 
 
438 aa  438  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 
427 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
444 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
427 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 
427 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 
444 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 
427 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 
426 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
428 aa  430  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
433 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
427 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 
429 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 
449 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
429 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
429 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
432 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
439 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  48.95 
 
 
426 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
429 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
439 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
439 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
436 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
451 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
436 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
429 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 
429 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 
424 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
428 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
429 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 
436 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 
424 aa  418  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  45.88 
 
 
429 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 
429 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
432 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
439 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>