More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0486 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 406 aa  797    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  73.72 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  41.36 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  37.37 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  36.45 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 		 508 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  36.5 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  38.3 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  37.76 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  34.29 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.33 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 414 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  38.72 
 
 		 401 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 468 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  43.27 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  41.03 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  32.89 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  39.04 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  35.14 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 490 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  31.93 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  34.87 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  37.5 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  31.46 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04040  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.631107  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1935  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.75 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  36.55 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  34.4 
 
 		 1031 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 742 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  33.59 
 
 		 1033 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  40.7 
 
 		 467 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  30.18 
 
 		 1048 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 725 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  30 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 574 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 682 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 546 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.88 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  35.78 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  30.48 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.05 
 
 		 830 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.76 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 682 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  37.68 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  34.38 
 
 		 501 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.87 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.3 
 
 		 456 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  24.46 
 
 		 597 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  28 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  28 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  28 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  28 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 780 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  28 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.39 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.56 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  29.89 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  32.99 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  37.2 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  36.71 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.56 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 501 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 655 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 610 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  27.45 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.15 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  30.51 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  39.38 
 
 		 470 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  32.92 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 658 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  34 
 
 		 640 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>