More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0466 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0466  resolvase  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  86.96 
 
 
193 aa  336  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  68.82 
 
 
188 aa  267  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  70.17 
 
 
185 aa  264  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  70.17 
 
 
185 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  68.85 
 
 
185 aa  261  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  68.51 
 
 
188 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  68.51 
 
 
185 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  68.51 
 
 
185 aa  257  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  68.33 
 
 
185 aa  255  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  68.33 
 
 
185 aa  255  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  68.89 
 
 
188 aa  253  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  59.44 
 
 
188 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  59.44 
 
 
187 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  59.44 
 
 
190 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  60.34 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  59.22 
 
 
184 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  58.33 
 
 
188 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  55.56 
 
 
197 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  56.18 
 
 
203 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  56.18 
 
 
219 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  54.49 
 
 
189 aa  190  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  56.32 
 
 
191 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  56.32 
 
 
191 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  50.26 
 
 
201 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  51.34 
 
 
193 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  59.12 
 
 
184 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  53.23 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  53.04 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  49.46 
 
 
201 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  52.54 
 
 
209 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  55.43 
 
 
201 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  54.02 
 
 
186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  51.15 
 
 
187 aa  178  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  61.59 
 
 
307 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  61.59 
 
 
307 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  53.45 
 
 
199 aa  177  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  61.59 
 
 
309 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  50.86 
 
 
188 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  53.11 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  46.67 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  46.07 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  46.07 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  49.72 
 
 
182 aa  171  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  50 
 
 
188 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  43.82 
 
 
181 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  51.1 
 
 
201 aa  168  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 
197 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 
197 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 
191 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  51.1 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  51.11 
 
 
228 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  50.55 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  46.93 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  50.29 
 
 
189 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  50.28 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  51.35 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  46.24 
 
 
190 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  46.24 
 
 
190 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  46.24 
 
 
190 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 
194 aa  161  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  47.75 
 
 
184 aa  161  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 
224 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 
196 aa  160  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  49.73 
 
 
204 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  51.05 
 
 
210 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  49.73 
 
 
204 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  52.22 
 
 
208 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 
198 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  46.93 
 
 
184 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  54.55 
 
 
190 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 
189 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 
205 aa  158  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  51.4 
 
 
214 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  51.4 
 
 
189 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  53.8 
 
 
176 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  50.28 
 
 
184 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
193 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
193 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
193 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  49.72 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 
195 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  44.02 
 
 
184 aa  151  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 
193 aa  151  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.02 
 
 
188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  49.19 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  44.13 
 
 
187 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  48.65 
 
 
204 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  48.65 
 
 
204 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  48.65 
 
 
204 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 
201 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.96 
 
 
186 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  51.35 
 
 
189 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 
185 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  50.54 
 
 
196 aa  148  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  45.76 
 
 
181 aa  148  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 
201 aa  148  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  48.3 
 
 
206 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>