More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0391 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.17 
 
 
340 aa  411  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  51.9 
 
 
302 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  50.87 
 
 
312 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  49 
 
 
319 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  49.5 
 
 
327 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.23 
 
 
335 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.66 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.41 
 
 
342 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  37.99 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  37.31 
 
 
303 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  37.31 
 
 
303 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 
301 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 
301 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  37.31 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  35.69 
 
 
304 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  35.69 
 
 
304 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  35.69 
 
 
304 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  35.69 
 
 
304 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  35.63 
 
 
304 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  35.69 
 
 
304 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  33.46 
 
 
287 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  32.57 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  33.72 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  34.62 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  35.62 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  32.36 
 
 
290 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  32.36 
 
 
290 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  33.1 
 
 
299 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  33.45 
 
 
299 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  33.45 
 
 
299 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  31.67 
 
 
314 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  32.78 
 
 
299 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  29.83 
 
 
306 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  32.86 
 
 
298 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.53 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  32.51 
 
 
298 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.6 
 
 
309 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.55 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.57 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.68 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.68 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.78 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  24.39 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.27 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.77 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.4 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  24.15 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.96 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  28.53 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.46 
 
 
314 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  32.5 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  27.2 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  27.2 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.4 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.8 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.48 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.26 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.39 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.4 
 
 
303 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.2 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.8 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.8 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.4 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.97 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  25.61 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  28.16 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.26 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.2 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.37 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.6 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.91 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.85 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.66 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.82 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  28.92 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.61 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.61 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.1 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  26.56 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  24.74 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  30.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.35 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  29.73 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>