More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0389 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  86.36 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  58.36 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  58.82 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  55.7 
 
 
307 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  50.65 
 
 
308 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  52.88 
 
 
306 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  57.19 
 
 
303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 
340 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  46.38 
 
 
304 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 
305 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  50.18 
 
 
300 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  46.45 
 
 
305 aa  255  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 
356 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  44.41 
 
 
301 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
301 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
301 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
301 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  49.49 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  42.62 
 
 
313 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  41.8 
 
 
312 aa  238  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  43.29 
 
 
305 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 
312 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 
306 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  45.28 
 
 
302 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 
305 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 
305 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  40.73 
 
 
299 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 
299 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  41.7 
 
 
305 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  39.14 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.02 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 
326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.24 
 
 
304 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.82 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 
305 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 
313 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  44.34 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
315 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 
305 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  39.14 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.82 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  45.78 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.14 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.14 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.14 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.61 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.4 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
307 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 
297 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  39.14 
 
 
295 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 
316 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  41.37 
 
 
316 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 
303 aa  205  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 
342 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  39.02 
 
 
298 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.9 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  40.37 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 
298 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  43.4 
 
 
327 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
398 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  38.96 
 
 
298 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  38.96 
 
 
298 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  38.96 
 
 
298 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 
343 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.73 
 
 
312 aa  190  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 
342 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  46.03 
 
 
247 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 
342 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 
342 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 
311 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 
347 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  35.71 
 
 
306 aa  187  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  37.63 
 
 
315 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.29 
 
 
328 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  40.81 
 
 
306 aa  186  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.75 
 
 
312 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  41.03 
 
 
378 aa  185  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  37.3 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.88 
 
 
312 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  38.23 
 
 
312 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  38.23 
 
 
312 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  37.88 
 
 
312 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  38.62 
 
 
313 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.27 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 
328 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>