More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0380 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  91.67 
 
 		 481 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 480 aa  931    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  68.21 
 
 		 496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.23 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.85 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  54.94 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.79 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.26 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.58 
 
 		 479 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.45 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  55.24 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.72 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  53.77 
 
 		 494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  55.21 
 
 		 493 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  54.02 
 
 		 484 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  53.86 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.3 
 
 		 517 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.08 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.05 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.23 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.88 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.43 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.42 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.83 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.52 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.9 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.27 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.9 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.55 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.41 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.07 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.51 
 
 		 465 aa  356  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.03 
 
 		 496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.43 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.01 
 
 		 456 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.01 
 
 		 456 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.38 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.27 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.93 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.12 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.88 
 
 		 438 aa  285  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.88 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.24 
 
 		 463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.97 
 
 		 441 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.38 
 
 		 438 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.56 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.25 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.09 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.08 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.85 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.86 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.64 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.86 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.5 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  35.56 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  36.54 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  36.54 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  36.54 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  36.54 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  36.54 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  36.32 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.32 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.66 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  36.32 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.41 
 
 		 444 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.41 
 
 		 444 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  36.32 
 
 		 441 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  36.11 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  38.68 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.75 
 
 		 436 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.93 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.23 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.63 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.2 
 
 		 442 aa  256  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  37.69 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.95 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.37 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  33.74 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.35 
 
 		 435 aa  253  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.38 
 
 		 467 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.87 
 
 		 428 aa  252  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  36.88 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  35.47 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.72 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.34 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  37.47 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.36 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.63 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.68 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.73 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  36.88 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.4 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>