More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0341 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
335 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.27 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 
365 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
256 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  38 
 
 
360 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
705 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  27.98 
 
 
258 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.51 
 
 
244 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 
503 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
255 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  28.99 
 
 
261 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
387 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.49 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 
368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.72 
 
 
260 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.75 
 
 
260 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.08 
 
 
271 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
199 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.44 
 
 
260 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.99 
 
 
260 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
228 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
258 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
699 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
280 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.17 
 
 
251 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
267 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
281 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.36 
 
 
267 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.41 
 
 
344 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.29 
 
 
279 aa  103  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.65 
 
 
468 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  30.77 
 
 
327 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.31 
 
 
417 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
299 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  32.29 
 
 
299 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
263 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  32.29 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
244 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
248 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  30.73 
 
 
299 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.69 
 
 
250 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 
238 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 
264 aa  99  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  31.63 
 
 
488 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
240 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.23 
 
 
251 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
465 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
542 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
215 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.74 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
324 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.16 
 
 
275 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
537 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
247 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
263 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  27.55 
 
 
235 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
250 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
413 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 
217 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.3 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.29 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
263 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>