290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0300 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  82.83 
 
 		 330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  51.21 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  51.37 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  52.99 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  50.9 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  52.69 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  52.69 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  50.45 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  47.51 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  50.16 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  46.22 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  44.11 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.75 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  44.21 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  42.3 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  43.31 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  41.57 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  43.61 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  43.15 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  43.99 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  41.96 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.94 
 
 		 307 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  32.26 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.93 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  36.31 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  34.7 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  34.7 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  34.7 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.57 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  36.33 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  33.43 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.54 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  35.94 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  31.82 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.8 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.89 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  38.73 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  34.06 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.93 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.93 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  38.28 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  38.24 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.38 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  36.66 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  35.84 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.61 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  35.22 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  37.05 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.7 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  29.12 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.06 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  27.6 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.07 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.26 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.26 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.49 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  29.26 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  31.96 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  39.16 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  32.92 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  33.24 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>