More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0256 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.43 
 
 		 1891 aa  653    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  53.15 
 
 		 1942 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  47.09 
 
 		 1975 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  77.04 
 
 		 1017 aa  1593    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 1005 aa  2060    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  60.91 
 
 		 925 aa  1023    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.85 
 
 		 1855 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.98 
 
 		 2068 aa  545  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  45.06 
 
 		 723 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  46.98 
 
 		 600 aa  512  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  43.91 
 
 		 609 aa  507  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  43.42 
 
 		 599 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  46.18 
 
 		 593 aa  489  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  47.15 
 
 		 614 aa  472  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  43.81 
 
 		 622 aa  469  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  39.8 
 
 		 604 aa  439  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  31.58 
 
 		 620 aa  230  9e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  28.98 
 
 		 885 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  29.72 
 
 		 838 aa  213  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 511 aa  201  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.59 
 
 		 510 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.68 
 
 		 814 aa  190  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 836 aa  181  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  29.2 
 
 		 564 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 		 524 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  44.29 
 
 		 1401 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  27.9 
 
 		 617 aa  164  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  27.12 
 
 		 610 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  48.28 
 
 		 1401 aa  163  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  29.02 
 
 		 624 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  27.24 
 
 		 617 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 		 528 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 528 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  28 
 
 		 576 aa  155  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 571 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  25.88 
 
 		 653 aa  154  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  28.26 
 
 		 686 aa  151  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.33 
 
 		 2638 aa  151  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 		 588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  25.44 
 
 		 619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.81 
 
 		 526 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  27.71 
 
 		 686 aa  148  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.51 
 
 		 533 aa  148  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.2 
 
 		 462 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 662 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.71 
 
 		 649 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 		 582 aa  145  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.92 
 
 		 642 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 		 486 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  27.93 
 
 		 690 aa  144  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.5 
 
 		 1248 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  26.83 
 
 		 688 aa  142  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.7 
 
 		 752 aa  142  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.42 
 
 		 1331 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 574 aa  140  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  26.41 
 
 		 676 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  28.16 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 587 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  26.41 
 
 		 676 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  26.23 
 
 		 676 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  26.41 
 
 		 676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  26.41 
 
 		 676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  26.41 
 
 		 676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  26.41 
 
 		 676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.26 
 
 		 477 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  25.82 
 
 		 687 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  25.99 
 
 		 687 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  26.32 
 
 		 676 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 487 aa  138  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  25.99 
 
 		 687 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.7 
 
 		 1021 aa  137  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  28.02 
 
 		 527 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  27.22 
 
 		 481 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  26.12 
 
 		 655 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  24.56 
 
 		 610 aa  135  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  26.82 
 
 		 694 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.34 
 
 		 488 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.99 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.38 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 659 aa  132  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  26.75 
 
 		 646 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 		 481 aa  132  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  25.57 
 
 		 676 aa  131  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  29.13 
 
 		 762 aa  130  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 509 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26.93 
 
 		 586 aa  127  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.69 
 
 		 586 aa  127  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 561 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.69 
 
 		 586 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.36 
 
 		 586 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24 
 
 		 586 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 		 853 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  26.4 
 
 		 481 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.11 
 
 		 566 aa  125  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.36 
 
 		 586 aa  124  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 521 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.47 
 
 		 623 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.41 
 
 		 739 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>