More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0253 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  100 
 
 
551 aa  1097    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  51.28 
 
 
537 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  43.01 
 
 
547 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  42.91 
 
 
556 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  40.81 
 
 
535 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  41.18 
 
 
564 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.22 
 
 
530 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.14 
 
 
575 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.96 
 
 
575 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.39 
 
 
535 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.19 
 
 
553 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.76 
 
 
537 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.89 
 
 
553 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 
532 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.68 
 
 
541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 
584 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.13 
 
 
542 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.63 
 
 
556 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.87 
 
 
527 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.99 
 
 
543 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.6 
 
 
522 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.45 
 
 
556 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  35.6 
 
 
501 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.39 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.44 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.13 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.39 
 
 
538 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.7 
 
 
606 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.98 
 
 
560 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
556 aa  170  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.53 
 
 
552 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 
603 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.39 
 
 
583 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.25 
 
 
616 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 
545 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  31.71 
 
 
538 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.58 
 
 
552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  31.57 
 
 
620 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.82 
 
 
555 aa  163  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.5 
 
 
522 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  32.5 
 
 
475 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.31 
 
 
601 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 
544 aa  160  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.64 
 
 
549 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  28.75 
 
 
541 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.54 
 
 
548 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.58 
 
 
546 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.8 
 
 
543 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.8 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.8 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.53 
 
 
533 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 
540 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  27.47 
 
 
520 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.05 
 
 
550 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.39 
 
 
539 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
579 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.04 
 
 
522 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 
569 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.69 
 
 
619 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.79 
 
 
560 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.8 
 
 
522 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
542 aa  150  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.96 
 
 
543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.52 
 
 
550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  26.88 
 
 
613 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 
536 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.99 
 
 
565 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.1 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  25.52 
 
 
582 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.07 
 
 
522 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.35 
 
 
553 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
544 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  29.21 
 
 
574 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.97 
 
 
522 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.82 
 
 
569 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.27 
 
 
541 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.61 
 
 
522 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  30.41 
 
 
543 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.01 
 
 
568 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  26.52 
 
 
608 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.89 
 
 
522 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.71 
 
 
540 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.89 
 
 
522 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.89 
 
 
522 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.94 
 
 
522 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.18 
 
 
557 aa  143  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  24.34 
 
 
580 aa  143  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.65 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  28.26 
 
 
564 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.89 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  27.9 
 
 
573 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.53 
 
 
564 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  27.51 
 
 
565 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  29.38 
 
 
554 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.04 
 
 
589 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  27.44 
 
 
563 aa  140  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.43 
 
 
563 aa  140  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>