195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0239 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  100 
 
 
508 aa  1000    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  62.74 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  56.47 
 
 
507 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  98.65 
 
 
222 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  47.61 
 
 
566 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  41.42 
 
 
585 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  47.06 
 
 
620 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  47.64 
 
 
568 aa  349  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  92.93 
 
 
228 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  36.42 
 
 
580 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  39.36 
 
 
535 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  38.78 
 
 
499 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  38.28 
 
 
551 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  45.6 
 
 
605 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  30.88 
 
 
603 aa  147  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  47.74 
 
 
580 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  31.07 
 
 
567 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  43.72 
 
 
628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  49.65 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  50.35 
 
 
584 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.9 
 
 
602 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30.75 
 
 
426 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  42.53 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  32 
 
 
443 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  32 
 
 
443 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  32.01 
 
 
516 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  34.41 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  30.97 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  41.14 
 
 
714 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.59 
 
 
310 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  44.78 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  40.65 
 
 
521 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  29.72 
 
 
404 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  29.72 
 
 
405 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  28.19 
 
 
424 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  29.41 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  26.46 
 
 
481 aa  87.8  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  30.46 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  37.87 
 
 
502 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  38.04 
 
 
523 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  27.04 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  29.45 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  26.47 
 
 
423 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  26.69 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  26.69 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  35 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  25.99 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  25.99 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  29.45 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  25.99 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  26.24 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  35.17 
 
 
748 aa  80.1  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  39.44 
 
 
577 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  28.88 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  38.73 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.34 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  29.76 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  25.43 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  29.47 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  24.37 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  26.22 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  25.31 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  25.53 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  25.33 
 
 
494 aa  73.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  37.19 
 
 
494 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  37.2 
 
 
661 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  23.68 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  25.47 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.49 
 
 
637 aa  70.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  33.33 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  28.41 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  38.17 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  36.92 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  28.12 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  28.12 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  24.85 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  37.33 
 
 
572 aa  67.8  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  24.23 
 
 
555 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  38.71 
 
 
414 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  26.69 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  24.62 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  26.93 
 
 
535 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  24.62 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  29.22 
 
 
256 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  24.03 
 
 
498 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  33.12 
 
 
407 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  35.4 
 
 
458 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  31.87 
 
 
413 aa  63.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  31.61 
 
 
519 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  36.43 
 
 
414 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  36.42 
 
 
469 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.2 
 
 
567 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  36.36 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  33.8 
 
 
709 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.06 
 
 
546 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  33.58 
 
 
561 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  24.62 
 
 
430 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  35.35 
 
 
438 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  36.36 
 
 
435 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>