More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0238 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  57.81 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  47.76 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  47.96 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  43.22 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  48.26 
 
 		 246 aa  128  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  37.2 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  36.7 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  38.64 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  35.87 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  37.14 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  41.46 
 
 		 239 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  38.75 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.33 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  35.59 
 
 		 471 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.95 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.37 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  37.01 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  37.16 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.6 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.22 
 
 		 521 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  34.04 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  37.1 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  32.82 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  34.04 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  34.04 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  34.04 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  30.69 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  32.81 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.83 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  33.52 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  33.01 
 
 		 268 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  31.4 
 
 		 256 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  33.51 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  34.12 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.96 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.96 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.96 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.96 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.96 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.51 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  34.87 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.47 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  32.86 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.18 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  32.2 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  34.57 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  29.23 
 
 		 682 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  31.21 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 682 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.28 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  31.63 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.28 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.28 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.28 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.28 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  35.03 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  35.36 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  29.59 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  30.57 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.28 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  35.95 
 
 		 241 aa  92.8  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.07 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.07 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  31.84 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  33.18 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  33.18 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  33.18 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  33.18 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  33.18 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  36.05 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  34.39 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  31.74 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  33.18 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  33.18 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 		 473 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  32.12 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  34.39 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  30.41 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  30.81 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  34.69 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>