47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0207 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  88.73 
 
 
206 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
206 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  31.55 
 
 
206 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  30.58 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  34.47 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  31.9 
 
 
210 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  30.58 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  32.04 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  32.84 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  31.07 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01660  hypothetical protein  32.39 
 
 
208 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  31.07 
 
 
205 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  28.1 
 
 
210 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  29.61 
 
 
205 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  26.7 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  30.62 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  29.19 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  28.22 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  25.82 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  25.48 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  23.94 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  23.94 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  24.3 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07400  hypothetical protein  26.38 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  22.54 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  26.35 
 
 
205 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  23.72 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  20.9 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  23.33 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  23.33 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  22.38 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  19.51 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  23.57 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  19.52 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  25.69 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  20.87 
 
 
390 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  20.47 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  20.67 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  20.57 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  21.53 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  22.79 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  21.67 
 
 
207 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  22.79 
 
 
210 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3507  phosphate transport regulator-like protein  25.62 
 
 
202 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000596439  normal  0.317857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>