More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0204 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  90.54 
 
 
370 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
369 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  61.13 
 
 
364 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  59.4 
 
 
367 aa  361  9e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.32 
 
 
358 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  55.27 
 
 
361 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.04 
 
 
359 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.41 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.69 
 
 
322 aa  325  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.81 
 
 
357 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  59.41 
 
 
317 aa  319  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  49.27 
 
 
383 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  55.48 
 
 
365 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.31 
 
 
309 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  53.31 
 
 
291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.72 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.9 
 
 
388 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  54.33 
 
 
297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  49.01 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.49 
 
 
359 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  51.96 
 
 
332 aa  262  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  51.16 
 
 
345 aa  260  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.51 
 
 
304 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.69 
 
 
299 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.05 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.17 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.92 
 
 
300 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.24 
 
 
300 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  45.24 
 
 
300 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.24 
 
 
300 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  48.96 
 
 
304 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.26 
 
 
300 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.78 
 
 
694 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.08 
 
 
303 aa  215  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.12 
 
 
317 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  45.67 
 
 
306 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.33 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.71 
 
 
412 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.75 
 
 
281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.93 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  40.89 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  37.71 
 
 
281 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.46 
 
 
301 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.46 
 
 
301 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
278 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.63 
 
 
284 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.19 
 
 
296 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.19 
 
 
296 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  35.35 
 
 
281 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.19 
 
 
296 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.43 
 
 
340 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.18 
 
 
296 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4514  phosphate ABC transporter permease  35.51 
 
 
293 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.2 
 
 
297 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  37.62 
 
 
297 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.19 
 
 
296 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.4 
 
 
396 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.94 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.33 
 
 
280 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  39.74 
 
 
297 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.94 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.94 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.97 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.97 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.97 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.97 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.97 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.97 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  37.29 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.67 
 
 
280 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.67 
 
 
280 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  35.14 
 
 
296 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  35.14 
 
 
296 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  34.97 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.97 
 
 
296 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  33.45 
 
 
296 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.62 
 
 
297 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.12 
 
 
288 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.62 
 
 
297 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.62 
 
 
297 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.15 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  36.75 
 
 
297 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  34.43 
 
 
287 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.8 
 
 
280 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.87 
 
 
297 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.87 
 
 
297 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.87 
 
 
297 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.46 
 
 
298 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.33 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.66 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.14 
 
 
298 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.33 
 
 
297 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  36.63 
 
 
297 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.59 
 
 
300 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.61 
 
 
294 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.98 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  32.77 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2018  phosphate transporter permease subunit PtsA  34.32 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  41.04 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09831  putative phosphate ABC transporter  34.17 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>