More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0140 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  93.66 
 
 
426 aa  812    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  75.18 
 
 
427 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
426 aa  871    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  68.56 
 
 
421 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  71.23 
 
 
416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  66.67 
 
 
420 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  67.37 
 
 
418 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  68.24 
 
 
424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  68.79 
 
 
422 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
431 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  66.59 
 
 
426 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  66.59 
 
 
426 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  65.73 
 
 
421 aa  544  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 
436 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  66.82 
 
 
426 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  63.15 
 
 
428 aa  539  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  65.88 
 
 
423 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  62.7 
 
 
425 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  66.04 
 
 
423 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  64.71 
 
 
422 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  61.03 
 
 
428 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  63.72 
 
 
419 aa  514  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  64.3 
 
 
420 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  64.11 
 
 
417 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  59.58 
 
 
424 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  65.01 
 
 
417 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  65.01 
 
 
417 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  65.01 
 
 
417 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  61.08 
 
 
433 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  64.07 
 
 
419 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
420 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 
422 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  63.64 
 
 
419 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
425 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
427 aa  322  6e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
424 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
423 aa  317  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
427 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
424 aa  312  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
424 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
423 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
424 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
424 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
426 aa  307  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
417 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
423 aa  302  7.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
431 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
425 aa  302  9e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
432 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
421 aa  300  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
431 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  39.76 
 
 
502 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
424 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
422 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
423 aa  299  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
425 aa  298  8e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
426 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
435 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
423 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
425 aa  298  1e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
425 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
431 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
427 aa  296  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
428 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
425 aa  296  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
425 aa  296  6e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
424 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
426 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
427 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
469 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
413 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
433 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>