More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0134 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 489 aa  960    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  57.41 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  55.72 
 
 		 484 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  53.39 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  51.68 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  52.26 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  44.47 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  42.08 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  42.5 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  41.41 
 
 		 495 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  42.62 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  41.56 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  39.88 
 
 		 499 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  38.12 
 
 		 499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  37.75 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  37.75 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  40.75 
 
 		 509 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  37.8 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  39.16 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  38.57 
 
 		 498 aa  306  7e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  38.12 
 
 		 501 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  36.38 
 
 		 501 aa  294  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  41.15 
 
 		 498 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  37.2 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  37.31 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  34.55 
 
 		 507 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  39.07 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  36.83 
 
 		 517 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.29 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  36.66 
 
 		 520 aa  260  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  36.75 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  35.93 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  35.93 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.07 
 
 		 517 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  33.26 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  37 
 
 		 501 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  34.92 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  33.61 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  33.4 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  33.93 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  33.2 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  34 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  30.18 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  30.58 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  33.03 
 
 		 534 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  33.7 
 
 		 491 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  33.64 
 
 		 446 aa  220  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  33.64 
 
 		 446 aa  220  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  34.32 
 
 		 490 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  32.78 
 
 		 432 aa  219  8.999999999999998e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  35.35 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  35.35 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  34.23 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  34.7 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  32.67 
 
 		 527 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  30.6 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  33.12 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.68 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  33.12 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  33.47 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  32.9 
 
 		 501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  30.39 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 501 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  30.44 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  30.39 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.98 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  30.44 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.01 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  31.81 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.7 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  32.24 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.55 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  32.09 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  31.37 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  31.37 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  30.63 
 
 		 539 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  30.63 
 
 		 539 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  29.85 
 
 		 539 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  30.67 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  30.52 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  31.25 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  30.46 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  30.46 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  30.46 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  32.33 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  29.02 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  30.83 
 
 		 533 aa  186  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  32.02 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  31.72 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  30.03 
 
 		 584 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>