232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0107 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  84.08 
 
 
449 aa  701  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
461 aa  897  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.36 
 
 
450 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.14 
 
 
450 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.15 
 
 
441 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  58.81 
 
 
434 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.52 
 
 
464 aa  493  1e-138  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  63.26 
 
 
462 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  62.58 
 
 
461 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.21 
 
 
447 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.7 
 
 
442 aa  459  1e-128  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  59.95 
 
 
437 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  57.6 
 
 
434 aa  453  1e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  55.12 
 
 
446 aa  446  1e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  62.87 
 
 
463 aa  445  1e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.11 
 
 
436 aa  438  1e-122  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  55.96 
 
 
436 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  58.14 
 
 
429 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  54.85 
 
 
453 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  59.18 
 
 
432 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.22 
 
 
436 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  55.58 
 
 
451 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  58.24 
 
 
539 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  51.33 
 
 
422 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50.37 
 
 
414 aa  355  7e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  56.46 
 
 
440 aa  352  6e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  46.4 
 
 
429 aa  327  2e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  46.65 
 
 
408 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  54.01 
 
 
431 aa  310  3e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  44.34 
 
 
433 aa  305  1e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  47.92 
 
 
442 aa  296  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  45.48 
 
 
401 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  45.87 
 
 
402 aa  289  9e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  42.39 
 
 
390 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  43.26 
 
 
413 aa  273  5e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.76 
 
 
391 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  45.8 
 
 
436 aa  263  5e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.89 
 
 
399 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.43 
 
 
394 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
397 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.83 
 
 
396 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.18 
 
 
404 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.98 
 
 
391 aa  253  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  41.63 
 
 
401 aa  252  9e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  40.71 
 
 
382 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  48.37 
 
 
447 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  1.7266e-05 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.73 
 
 
391 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  38.88 
 
 
425 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 
389 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.09 
 
 
399 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.61 
 
 
400 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 
389 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 
389 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 
389 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
391 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.96 
 
 
396 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.19 
 
 
382 aa  245  1e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 
389 aa  244  2e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.8 
 
 
406 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.04 
 
 
391 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.72 
 
 
389 aa  243  4e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  38.21 
 
 
455 aa  242  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 
393 aa  240  3e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.1 
 
 
394 aa  241  3e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  36.92 
 
 
396 aa  240  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.29 
 
 
395 aa  240  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.93238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.49 
 
 
383 aa  240  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 
389 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.73 
 
 
382 aa  239  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.38 
 
 
409 aa  239  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 
389 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.99 
 
 
407 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.25 
 
 
390 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.72 
 
 
424 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  41.54 
 
 
399 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.27 
 
 
391 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.1 
 
 
400 aa  237  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  41.51 
 
 
423 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.68 
 
 
391 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  36.13 
 
 
382 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.88 
 
 
386 aa  235  1e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.4 
 
 
398 aa  234  2e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  35.88 
 
 
382 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.46 
 
 
392 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.92 
 
 
399 aa  233  4e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  38.65 
 
 
393 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 
397 aa  233  7e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.59 
 
 
420 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  36.13 
 
 
382 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  38.85 
 
 
408 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  40.34 
 
 
392 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.96 
 
 
408 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.43 
 
 
391 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.15 
 
 
392 aa  231  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.59 
 
 
393 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 
397 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 
391 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  42 
 
 
391 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.26 
 
 
455 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.11 
 
 
388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>