More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0092 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  82.59 
 
 		 225 aa  339  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  52.29 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  51.49 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 194 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  43.72 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  42.71 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  40.39 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  40.7 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  37.09 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  32.18 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  30.46 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  33.99 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>