More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0083 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  77.1 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  47.15 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  42.17 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  50.49 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.19 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.39 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.66 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  41.32 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  41.32 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  41.23 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.19 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  43.65 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.58 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  36.89 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42.21 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  42.44 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42.21 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.7 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.13 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  42.59 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  42.48 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  39.42 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.54 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.28 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  44.16 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  37.9 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  44.16 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  44.16 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  39.69 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.48 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39.03 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.37 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.9 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.06 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.94 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  42.48 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  42.48 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  39.3 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.34 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.39 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.16 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.78 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  41.14 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  39.62 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  39.62 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  39.62 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  39.61 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  39.3 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  39.3 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  39.3 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  39.3 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37.54 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.21 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.54 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.47 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  33.44 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37.46 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  42.72 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.07 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  36.45 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  41.86 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.2 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  41.56 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  38.83 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.64 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.64 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  38.64 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.64 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  36.69 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  41.67 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.64 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.04 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  35.81 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  38.51 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  36.04 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  39.81 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.36 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.31 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  39.16 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  33.44 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  40.53 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  40.51 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.02 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  37.9 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32.28 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  42.81 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  42.47 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  36.7 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  38.8 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  37.22 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  41.02 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  40.71 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.19 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.26 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  30.26 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  40.71 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>