More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0076 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  68.13 
 
 
188 aa  258  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  66.12 
 
 
184 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  63.22 
 
 
186 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  64.53 
 
 
185 aa  234  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  61.96 
 
 
184 aa  228  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 
174 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 
216 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 
174 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
174 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  35.61 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  32.28 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.78 
 
 
359 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  35.51 
 
 
359 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.65 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.65 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 
177 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.65 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.56 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  33.82 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  30.59 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  29.93 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  34.04 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  32.26 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  31.95 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  30.47 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  30.08 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.21 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  29.28 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  31.97 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.81 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  25.7 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  31.15 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  34.62 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  25.7 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  26.26 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  25.7 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>