116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0059 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0059  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0048  transcriptional regulator, LysR family  72.43 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  38.76 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  40.38 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1918  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2610  LysR, substrate-binding  39.51 
 
 		 197 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175126  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1818  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1897  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.843455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2045  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.416404  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4302  LysR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1801  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1820  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.822688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1867  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.749679  normal  0.902128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08160  LysR family regulator  39.57 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2644  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13200  LysR family regulator  34.9 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0541  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  26.97 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00910  hypothetical protein  28.94 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  29.76 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  29.38 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2452  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 308 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 303 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 303 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0054  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 304 aa  48.5  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 323 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 313 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 300 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 335 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 		 316 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 319 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4157  LysR substrate-binding protein  28.92 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  25.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4429  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.43 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  26.38 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 319 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 319 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  32.91 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  23.03 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 315 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  26.7 
 
 		 319 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  26.7 
 
 		 319 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  26.7 
 
 		 319 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3286  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 313 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254644  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  21.47 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>