114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0054 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0054  levanase  100 
 
 
511 aa  1048    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  67.56 
 
 
526 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  58.57 
 
 
497 aa  571  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  48.24 
 
 
544 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  47.54 
 
 
546 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  48.53 
 
 
557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  47.35 
 
 
554 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  48.24 
 
 
572 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  48.04 
 
 
545 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  47.35 
 
 
554 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  47.07 
 
 
554 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  47.84 
 
 
545 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  47.07 
 
 
554 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  47.07 
 
 
554 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  47.15 
 
 
554 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  47.07 
 
 
554 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  48.04 
 
 
545 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  47.25 
 
 
566 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  43.44 
 
 
551 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  42.41 
 
 
507 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  42.54 
 
 
473 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  37.12 
 
 
1203 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  40.67 
 
 
507 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  39.79 
 
 
738 aa  311  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  42.14 
 
 
472 aa  309  9e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  39.41 
 
 
506 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.54 
 
 
507 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  36.73 
 
 
531 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  57.98 
 
 
851 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  52.69 
 
 
705 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.17 
 
 
473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  34.02 
 
 
576 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  36.47 
 
 
1220 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  34.52 
 
 
1413 aa  250  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  34.67 
 
 
652 aa  246  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  37.18 
 
 
440 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  34.32 
 
 
519 aa  236  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.38 
 
 
1418 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  34.72 
 
 
1267 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  34.1 
 
 
664 aa  220  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.41 
 
 
491 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.17 
 
 
491 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.14 
 
 
818 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.11 
 
 
480 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  32.57 
 
 
492 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.81 
 
 
493 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  30.43 
 
 
681 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.54 
 
 
454 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.76 
 
 
480 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.07 
 
 
493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.55 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.81 
 
 
499 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  28.54 
 
 
489 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  30.45 
 
 
480 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.4 
 
 
518 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  30.36 
 
 
476 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  30.1 
 
 
476 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  27.99 
 
 
432 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  27.8 
 
 
432 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.02 
 
 
511 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.71 
 
 
481 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.07 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.05 
 
 
470 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.63 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.33 
 
 
487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  30.02 
 
 
473 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.88 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.09 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.35 
 
 
494 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.35 
 
 
494 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.08 
 
 
469 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.14 
 
 
490 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.55 
 
 
469 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  28.02 
 
 
467 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  28.74 
 
 
740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.46 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.15 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.46 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.71 
 
 
469 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  25.2 
 
 
451 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  25.91 
 
 
491 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  25.71 
 
 
491 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  27.16 
 
 
553 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  29.84 
 
 
469 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.29 
 
 
705 aa  123  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.35 
 
 
496 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  27.27 
 
 
546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.95 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.69 
 
 
574 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0712  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.09 
 
 
525 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00405775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.81 
 
 
464 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.84 
 
 
787 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.72 
 
 
479 aa  104  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  23.87 
 
 
487 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.43 
 
 
754 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.11 
 
 
487 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  34.36 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.15 
 
 
480 aa  96.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.83 
 
 
566 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.21 
 
 
489 aa  94  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>