More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0048 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
513 aa  1056    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  86.89 
 
 
425 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  58.74 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  48.37 
 
 
419 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  46.9 
 
 
419 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  31.7 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
428 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
484 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.75 
 
 
486 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
439 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.02 
 
 
439 aa  97.8  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
439 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
424 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.74 
 
 
439 aa  95.9  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
411 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
428 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
414 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
435 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
451 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
446 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
421 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
412 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
447 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.87 
 
 
496 aa  87.8  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
448 aa  87  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.29 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
431 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.06 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
455 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.35 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.86 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  24.11 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.05 
 
 
422 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.75 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  33.77 
 
 
558 aa  77.4  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
422 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 
435 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
522 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.75 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.65 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.83 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>