218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0027 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
365 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  58.26 
 
 
357 aa  352  5e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  54.98 
 
 
364 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.65 
 
 
360 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.54 
 
 
331 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  36.22 
 
 
335 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.02 
 
 
323 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 
331 aa  172  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  33.21 
 
 
354 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  35 
 
 
348 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.94 
 
 
1075 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 
342 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.22 
 
 
375 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  30 
 
 
674 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 
344 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
915 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  30.13 
 
 
381 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  29.78 
 
 
778 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  32.62 
 
 
330 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1004 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.87 
 
 
344 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.78 
 
 
686 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.9 
 
 
1238 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
1004 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  29.02 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  28.2 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  30.93 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.7 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.03 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  30.51 
 
 
334 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.51 
 
 
329 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  24.65 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  27.94 
 
 
721 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.25 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.25 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.25 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.48 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  28.11 
 
 
336 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.34 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.2 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  28.94 
 
 
593 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  30.12 
 
 
382 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.93 
 
 
333 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.93 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.18 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.81 
 
 
1065 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  29.18 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.85 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  29.18 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  30.14 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.76 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  27.57 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  28.18 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.9 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  30.49 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.61 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  27.35 
 
 
856 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  28.33 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  28.94 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.24 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  26.34 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  29.55 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.02 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.64 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.05 
 
 
326 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.63 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.63 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  25.51 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.37 
 
 
794 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.86 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.38 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.72 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.19 
 
 
775 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  28.46 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  26.27 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  28.78 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
893 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  25.4 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.02 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  25.63 
 
 
821 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  28.22 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.05 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.84 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.51 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.19 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>