More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0022 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  80.53 
 
 
486 aa  789    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
486 aa  989    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  43.42 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.53 
 
 
483 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  43.32 
 
 
489 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.48 
 
 
493 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.55 
 
 
485 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.55 
 
 
481 aa  345  8e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  39.8 
 
 
482 aa  342  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.7 
 
 
483 aa  340  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 
485 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.51 
 
 
480 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 
489 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.64 
 
 
490 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  39.14 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 
485 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.72 
 
 
488 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.63 
 
 
485 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
490 aa  296  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
491 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
491 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
491 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.85 
 
 
487 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.81 
 
 
491 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
493 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  36.52 
 
 
489 aa  280  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  36.42 
 
 
488 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  35.98 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.59 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  35.86 
 
 
488 aa  270  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  36.76 
 
 
495 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  35.76 
 
 
504 aa  266  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 
482 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
504 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
484 aa  256  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  34.2 
 
 
489 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
501 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
503 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  34.87 
 
 
492 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
478 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
490 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  34.58 
 
 
493 aa  219  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
503 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
458 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
470 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  34.55 
 
 
933 aa  207  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
461 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  32.47 
 
 
471 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
472 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.12 
 
 
476 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
547 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  32.58 
 
 
921 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
924 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 
954 aa  184  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.72 
 
 
972 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.43 
 
 
711 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.2 
 
 
487 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.39 
 
 
487 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  30.88 
 
 
579 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
577 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 
578 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
574 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 
704 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 
573 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 
553 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 
605 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.68 
 
 
695 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.28 
 
 
740 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 
570 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 
584 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
559 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  30.98 
 
 
645 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.24 
 
 
713 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
649 aa  146  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  30 
 
 
661 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  30 
 
 
661 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
672 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2265  penicillin-binding protein 3  30 
 
 
661 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4105599999999994e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2238  penicillin-binding protein 3  30 
 
 
661 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000023716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 
730 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 
646 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.92 
 
 
646 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2063  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
661 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00114706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 
669 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  29.92 
 
 
600 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  27.45 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3103  penicillin-binding protein 3  29.56 
 
 
661 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0111919  hitchhiker  0.000000000000561272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  27.88 
 
 
708 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  29.33 
 
 
661 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  29.97 
 
 
739 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  29.71 
 
 
739 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
723 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.63 
 
 
640 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 
664 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
701 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  31.08 
 
 
551 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 
610 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  27.78 
 
 
610 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.76 
 
 
586 aa  136  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>