79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0009 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  81.79 
 
 
312 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.96 
 
 
286 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  42.76 
 
 
306 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.92 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  39.66 
 
 
305 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  39.74 
 
 
306 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 
305 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  42.36 
 
 
319 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
300 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
300 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.32 
 
 
295 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  28.16 
 
 
294 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
302 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  30.17 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  30.17 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  28.33 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  31.47 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  27.53 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  36.1 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  25.85 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  32.91 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  32.78 
 
 
316 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  28.8 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  29.29 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  28.34 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  27.5 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.09 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  29.11 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.72 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.91 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.32 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.32 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  28.67 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  25.51 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  34.08 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  28.39 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  30.42 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  30.94 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  37.39 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  31.63 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  29.66 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  29.34 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  25.32 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  28.76 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  22.27 
 
 
294 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  30.71 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.2 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  27.76 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  29.92 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>