More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0002 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  94.65 
 
 		 374 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 374 aa  751    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  64.78 
 
 		 374 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  62.83 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  64.27 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.76 
 
 		 376 aa  472  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.44 
 
 		 376 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.11 
 
 		 378 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.86 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  51.6 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.97 
 
 		 408 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  52.52 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.26 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.07 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.13 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.97 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  51.19 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.13 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.3 
 
 		 387 aa  358  6e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.58 
 
 		 378 aa  354  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.99 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.89 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.81 
 
 		 388 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  50 
 
 		 377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.51 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  44.39 
 
 		 374 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.63 
 
 		 402 aa  338  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  47.11 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  41.71 
 
 		 374 aa  335  5.999999999999999e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  45.74 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.73 
 
 		 377 aa  332  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  44.62 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  46.24 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.3 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.01 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.3 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  44.3 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.66 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  49.87 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.97 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  44.53 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  45.58 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  38.18 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  37.76 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.26 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.77 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.72 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.98 
 
 		 378 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  33.61 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.29 
 
 		 381 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.98 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.81 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.29 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  26.29 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.17 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.17 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.29 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  27.51 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.91 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.04 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.16 
 
 		 385 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.76 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  25.8 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  26.06 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  26.75 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.4 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  27.2 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.61 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.53 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.71 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.02 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.59 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  25.4 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  26.25 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>